BPI 含折叠蛋白,B 家族,成员 2;BPIFB2

杀菌类渗透性蛋白 1;BPIL1
BPI样1
RYSR

HGNC 批准的基因符号:BPIFB2

细胞遗传学定位:20q11.21 基因组坐标(GRCh38):20:33,007,704-33,023,703(来自 NCBI)

▼ 说明

BPIL1与脂质转移(LT)/脂多糖(LPS)结合蛋白(LBP)的成员具有显着的相似性;151990)家人。所有 LT/LBP 蛋白都能够结合磷脂和 LPS。有些参与脂质转运和代谢(例如CETP;118470),其他参与宿主对革兰氏阴性细菌感染的反应(例如BPI;109195)(Mulero 等人总结,2002)。

▼ 克隆与表达

Mulero等(2002)通过在EST数据库中搜索与BPI相似的序列,然后对气管cDNA文库进行筛选和5-prime RACE,克隆了BPIL1。推导的 458 个氨基酸的蛋白质包含 N 端信号序列,与 BPI 具有 21% 的同一性。结构模型预测,与 BPI 一样,BPIL1 呈现出由 2 个结构域组成的回飞镖样构象,每个结构域的凹面均包含一个疏水袋。BPIL1 还具有 4 个潜在的 N-糖基化位点和 2 个保守的半胱氨酸,预计可形成二硫桥以锚定 N 末端结构域。PCR分析检测扁桃体中BPIL1表达,胎儿肝脏中表达较低。在检查的其他组织中未检测到表达。Real-time PCR检测BPIL1和BPIL3(BPIFB6)表达较高;614110)在肥大的扁桃体中比在正常的扁桃体中。

通过在嗅上皮EST数据库中搜索与大鼠Ry2g5(BPIFB4;BPIFB4;Andrault et al.(2003)通过对人胎儿脑 cDNA 文库的 PCR 和全人胎儿 cDNA 的巢式 PCR 克隆了 BPIFB2,并将其命名为 RYSR(615718)。推导的 458 个氨基酸的蛋白质具有 N 端信号肽、富含亮氨酸的区域、2 个保守的半胱氨酸和 3 个保守的脯氨酸。它与 462 个氨基酸的老鼠直系同源物有 68% 的氨基酸同一性。对 14 只小鼠组织进行 RT-PCR 分析,检测到 Rysr 在睾丸、嗅上皮、舌头和喉中高表达,而在大脑中表达较弱。数据库分析检测到人喉癌、人肝癌细胞系和小鼠舌中的 RYSR 序列。荧光标记的人 RYSR 在转染的 HEK293 细胞中以细胞质点状分布表达。

▼ 基因结构

Mulero等人(2002)确定BPIL1基因含有15个外显子。

Andrault et al.(2003)确定BPIFB2基因包含16个外显子,长度约为16.7 kb。第一个外显子是非编码的。

▼ 测绘

Mulero等(2002)通过体细胞杂交、辐射杂交和数据库分析,将BPIL1基因(BPIFB2)定位到染色体20q11,距BPIFB6基因约8 kb。

Andrault等(2003)通过基因组序列分析发现BPIFB2、BPIFB3(615717)和BPIFB4基因聚集在染色体20q11.21上。直系同源小鼠基因簇对应到染色体 2H2 区域,与人类染色体 20q11.21 具有同源性。

▼ 进化

通过对蛋白质序列、基因组组织和物种保护的分析,Andrault 等人(2003)确定,包含 BPIFB2、BPIFB3 和 BPIFB4 的基因簇在哺乳动物中是通过祖先基因(可能是 BPI(109195))的复制而产生的。小鼠和人类的差异。

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