小 ADP 核糖基化因子 GTP 酶激活蛋白 1; SMAP1
小 ARF 间隙 1
基质膜相关蛋白 1
HGNC 批准的基因符号:SMAP1
细胞遗传学定位:6q13 基因组坐标(GRCh38):6:70,667,883-70,862,015(来自 NCBI)
▼ 说明
SMAP1 是 ARF6(600464)的 GTPase 激活蛋白,可结合网格蛋白(参见 CLTC;118955)并调节网格蛋白依赖性内吞作用(Tanabe et al., 2005)。
▼ 克隆与表达
Sato等人(1998)使用针对小鼠脾基质细胞的单克隆抗体筛选了小鼠红白血病细胞和小鼠脑cDNA表达文库,并克隆了2个小鼠Smap1亚型,一个推导的440个氨基酸亚型和一个推导的467个氨基酸亚型酸异构体,来自大脑。Sato等(1998)通过免疫组织化学研究,在胚胎发生过程中的造血组织中检测到了小鼠Smap1蛋白,其中在红细胞生成期间(第10.5-18.5天)在胎儿肝基质细胞中表达水平最高。
Marcos et al.(2002)通过以小鼠Smap1为探针进行数据库分析,并对人骨髓和外周血RNA进行RT-PCR,克隆了人SMAP1。推导的 468 个氨基酸的 SMAP1 蛋白预计是一种 II 型膜糖蛋白,其 C 端区域朝向细胞外部。SMAP1 包含 2 个 KKD/E 重复单元,与 MAP1A(600178)和 MAP1B(157129)中鉴定的微管相关单元相似,一个推定的跨膜区域和一个 ArfGap 结构域(Arf 的 GTPase 激活蛋白)。SMAP1 与小鼠同源物有 86% 的同源性。Marcos et al.(2002)利用 RT-PCR 分析,鉴定出全长转录本和不包括外显子 5 的选择性剪接形式。Northern blot 分析在所有研究的人体组织中检测到这两种转录本,包括骨髓、肾上腺、气管、淋巴淋巴结、脊髓、甲状腺和胃。含有外显子 5 的转录物在脊髓和甲状腺中的表达较高。
▼ 基因功能
Sato等人(1998)在MSS62细胞中使用反义mRNA表明,小鼠Smap1 mRNA的消耗减少了红系集落的形成。他们得出结论,Smap1 可能会刺激红细胞生成。
Tanabe et al.(2005)表明,细菌中全长SMAP1的表达通过抑制细胞生长而产生毒性。N端截短的SMAP1特异性催化GTP水解Arf6-GTP(ARF6; 600464)底物和SMAP1 arg61,与GAP1(RASA1;RASA1;139150),是GTP水解活性所必需的。HeLa细胞中过表达全长SMAP1抑制转铁蛋白受体(TFRC;190010),通常发生在该细胞系中。进一步的研究表明,SMAP1 的过度表达特异性抑制 ARF6 调节的网格蛋白依赖性内吞途径。双重免疫荧光研究表明,SMAP1 过表达导致 AP-2(见 601025)和网格蛋白重链(CLTC;118955),可能会损害涂层凹坑的补充。通过膜突起的诱导进行测定,肌动蛋白重组不受 SMAP1 过表达的影响。Tanabe et al.(2005)指出,缺乏GTP水解活性的SMAP1 R61Q突变体的过度表达仍然抑制转铁蛋白受体内吞作用,但机制不同,AP-2被募集到包被凹坑,而在包被凹坑上没有检测到网格蛋白重链。Tanabe 等人(2005)使用 SMAP1 突变体的 GST Pull-down 测定表明,SMAP1 通过推定的网格蛋白框序列直接与 CLTC 相互作用。网格蛋白框序列是抑制网格蛋白依赖性内吞作用所必需的。通过 siRNA 敲低 SMAP1 表达,消除了转铁蛋白受体的内吞作用。Tanabe et al.(2005)得出结论,网格蛋白依赖性内吞作用需要内源性SMAP1。
Kobayashi等人(2014)利用缺乏Smap1和/或Smap2(616916)的小鼠胚胎成纤维细胞发现,任一Smap都足以进行转铁蛋白受体的Arf6依赖性内吞作用,而转铁蛋白(TF; 190000)只有在 Smap1 和 Smap2 都不存在的情况下,掺入才会受到损害。免疫共沉淀分析显示 Smap1 和 Smap2 相互作用。结构域分析表明,Smap1 的中央或 C 端结构域和 Smap2 的 C 端结构域介导了相互作用。
▼ 基因结构
Marcos et al.(2002)确定SMAP1基因包含11个外显子,长度约为100 kb。
▼ 测绘
Marcos等(2002)通过基因组序列分析,将SMAP1基因定位于D6S455和D6S1673之间的染色体6q13。