转录因子 Sp3; SP3

SP3/EWS 融合基因, 包含

HGNC 批准的基因符号:SP3

细胞遗传学定位:2q31.1 基因组坐标(GRCh38):2:173,900,775-173,965,702(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

转录调控是通过与靶基因附近的不同 DNA 元件结合的蛋白质因子来实现的。许多控制元件被转录因子家族识别,为调控相互作用提供了组合的可能性。分布最广泛的控制元件是GC框和SP1(189906)结合的相关基序。Kingsley和Winoto(1992)指出,在T细胞中,与GC框类似的共有GT框与SP1结合。凝胶位移分析表明其他调节蛋白也结合 GT 框。然后他们使用 SP1 锌指结构域作为探针克隆了 2 个新的 cDNA。这些新的转录因子被他们称为SP2(601801)和SP3,编码具有多个反式激活结构域和一个与SP1同源的锌指DNA结合结构域的蛋白质。SP3 cDNA 编码 713 个氨基酸的开放阅读码组。他们发现SP3的氨基酸序列与SP1的锌指区域内的氨基酸序列有90%的同源性,并且整个蛋白质具有显着的同源性。Kingsley和Winoto(1992)发现,当体外表达时,SP1和SP3都与GC-和GT框调控元件强烈结合。

Hagen等人(1992)孤立地对与子宫珠蛋白启动子的GT基序结合的因子进行了识别位点筛选。他们分离出了SP3和SP4(600540),分别将其称为SPR2和SPR1(针对Sp相关因子2和1)。Northern 印迹分析表明,SP3 在所有测试的细胞系和组织中均以 5.0 kb 信息的形式表达。

▼ 测绘

Kalff-Suske et al.(1996)利用人-啮齿动物杂交细胞系DNA的PCR分析和荧光原位杂交将人Sp3基因定位到2q31。他们报告说,Sp3 到 2q31 的映射,以及之前 Sp1 到 12q13 和 Sp4 到 7p15 的分配,增加了人类染色体 2、7 和 12 上已知的旁系同源关系的数量。作者注意到这些 Sp 因子中的每一个都具有相应染色体上的同源基因基因簇 HOX A、HOX C 和 HOX D。

▼ 基因功能

Hagen等人(1994)发现SP3抑制SP1介导的转录激活,表明SP3是SP基因家族的抑制性成员。

圆锥角膜是一种常见的角膜营养不良,会导致严重的视力障碍。在受圆锥角膜影响的角膜中,Lambiase 等人(2005)发现参与基因抑制的 SP3 短异构体的表达显着增加,而参与基因激活的长 SP3 异构体的表达缺失。与 SP3 表达改变相关的是 TRKA(NTRK1;NTRK1;191315)NGF的表达和表达降低(见NGFB;162030)和p75(NTR)(NGFR;162010)。此外,人角膜角膜细胞原代培养物中短 SP3 亚型的表达导致 TRKA 表达下调。Lambiase et al.(2005)推测SP转录因子异构体的失衡可能在控制NGF信号传导中发挥作用,从而促进圆锥角膜的发病机制。

SP3/EWS融合基因

Wang等(2007)在一名患有骨外未分化小圆细胞肿瘤的16岁男孩的肿瘤组织中鉴定出SP3/ EWS(133450)融合基因(见612219)。他的硬膜外区域、肺和肾都有病变。EWS N 末端结构域与 SP3 的锌指 DNA 结合结构域融合。

▼ 历史

Yao等人(2006)关于mSin3A甲基乙二醛修饰的论文被撤回,因为发现几张图中的面板存在错误。

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