SPARC 相关模块化钙结合蛋白 2; SMOC2
分泌的模块化钙结合蛋白 2
平滑肌相关蛋白 2;SMAP2
HGNC 批准的基因符号:SMOC2
细胞遗传学定位:6q27 基因组坐标(GRCh38):6:168,441,184-168,667,992(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nishimoto等人(2002)在主动脉3引物导向的cDNA文库中鉴定了SMAP2,并从心脏cDNA文库中获得了全长克隆。推导的 446 个氨基酸的蛋白质包含 2 个 1 型甲状腺球蛋白结构域、2 个 EF 手钙结合结构域和一个推定的信号肽。它与小鼠 Smoc2 具有 94% 的序列同一性。RNA点印迹分析显示骨骼肌、心脏、卵巢、睾丸、膀胱、子宫、胃、小肠、结肠、甲状腺、乳腺和前列腺中表达最高。在所有其他测试组织中均检测到弱表达。
Bloch-Zupan et al.(2011)通过RT-PCR证明SMOC2在人体组织中广泛表达,包括皮肤、肝脏、肌肉、肺、脾、结肠、胰腺和肾脏。对小鼠口腔牙齿发育过程中 Smoc2 表达的分析显示,磨牙中的 Smoc2 表达高于切牙胚芽中的表达,并且在胚胎 14.5 天的口腔外胚层和外牙上皮以及面向磨牙上皮环的间充质乳头中发现了 Smoc2 表达,并且是唯一的表达。切牙的舌环。
▼ 测绘
国际辐射混合图谱联盟将SMOC2基因定位到染色体6(WI-13584)。
▼ 基因功能
Nishimoto等人(2002)利用大鼠颈动脉腔内球囊损伤模型发现,Smap2 mRNA在球囊损伤后第3天上调,在第7天达到峰值,并在升高的水平持续14天。上调伴随着内侧血管平滑肌细胞增殖和迁移至内膜。
Bloch-Zupan 等人(2011)在斑马鱼中敲低 smoc2,观察到咽齿具有类似于人类表型的异常。此外,斑马鱼中 smoc2 的缺失改变了与牙发育有关的 3 个主要基因的表达:dlx2(126255)、bmp2(112261)和pitx2(601542)。
▼ 分子遗传学
在来自近亲土耳其血统的 2 个受影响的表亲中,患有与极端小牙和牙齿畸形相关的 I 型牙本质发育不良,并对应到染色体 6q27-qter(参见 125400),Bloch-Zupan 等人(2011)鉴定了候选基因SMOC2(607223.0001)剪接位点突变。
AlFawaz 等人(2013)在来自巴基斯坦近亲家庭的 3 名患少牙、小牙和牙齿形状异常的同胞中鉴定出 SMOC2 基因(C227X;C227X;607223.0002)。该突变与家族中的疾病分离,并且在公共变异数据库中未发现。
▼ 等位基因变异体(2个精选例子):
.0001 牙本质发育不良,I 型,伴有极度小齿和牙齿畸形
SMOC2、IVS1DS、GT、84+1
在来自土耳其近亲血统的 2 个受影响的表亲中,患有与极端小牙和畸形牙齿相关的 I 型牙本质发育不良(参见 125400),Bloch-Zupan 等人(2011)在 84+1G-T 颠换处鉴定了纯合性SMOC2 基因内含子 1 中的供体剪接位点。未受影响的父母和同胞的突变是杂合的,而在 112 名种族匹配的对照中未发现这种突变。
.0002 牙本质发育不良,I 型,伴有极度小齿和牙齿畸形
SMOC2、CYS227TER
AlFawaz 等人(2013)在来自巴基斯坦近亲家庭的 3 名患有少牙、小牙和牙齿形状异常的同胞中(见 125400)发现了 c.681T-A 颠换的纯合性(c.681T-A, NM_022138.2) )位于 SMOC2 基因的外显子 8 中,导致 cys227-to-ter(C227X) 取代。他们的表亲父母和 3 个未受影响的同胞均具有该突变杂合子,而 dbSNP、1000 基因组计划或 NHLBI 外显子组变异计划数据库中未发现该突变。