mRNA 脱帽增强子 3;EDC3

mRNA 脱盖增强子 3,酿酒酵母,同源物
Yjef 域包含蛋白;YJDC
Yjef N 末端结构域蛋白 2;YJEFN2
YJEFN 域包含蛋白 2

HGNC 批准的基因符号:EDC3

细胞遗传学定位:15q24.1 基因组坐标(GRCh38):15:74,630,558-74,696,024(来自 NCBI)

▼ 说明

EDC3 与 mRNA 脱帽复合物相关,该复合物需要在 5-prime 末端降解之前从 mRNA 中去除 5-prime 帽(Fenger-Gron et al., 2005)。

▼ 克隆与表达

Fenger-Gron 等人(2005)利用质谱法从 HEK293 细胞裂解物中与脱帽酶 DCP1A(607010)共免疫纯化的几种蛋白质中鉴定出了 EDC3。EDC3含有508个氨基酸,具有N端Sm结构域,随后是FDF结构域和C端YjeF-N结构域。EDC3 与 HeLa 细胞细胞质加工体内的脱帽蛋白一起定位。

Rudolph等(2007)通过数据库分析和RT-PCR克隆了人YJEFN2。推导的 508 个氨基酸的 YJEFN2 蛋白的计算分子量为 56.1 kD。如AIBP(NAXE;608862),YJEFN2拥有C端YJEFN结构域,但缺乏分泌信号肽。Northern 印迹分析仅在睾丸中检测到 1.7 和 3.4 kb 的 YJEFN2 转录本。人体组织RT-PCR显示YJEFN2主要在脑、乳腺、卵巢和睾丸中表达。免疫组织化学分析表明,在人睾丸中,YJEFN2几乎只在减数分裂II的精子细胞和支持细胞的顶膜中表达。在卵巢中,在卵泡膜细胞和颗粒细胞中检测到 YJEFN2。Western blot分析在睾丸和精子中检测到表观分子质量为62 kD的YJEFN2蛋白。

▼ 基因结构

Rudolph et al.(2007)确定EDC3基因包含6个外显子,跨度51 kb。

▼ 测绘

Rudolph et al.(2007)指出EDC3基因定位于染色体15q23。

▼ 基因功能

Fenger-Gron et al.(2005)利用质谱分析发现EDC3、RCK(DDX6;600326)、HEDLS(EDC4;606030)与 HEK293 细胞裂解液中的 DCP1A 和 DCP2(609844)共免疫纯化。HeLa 细胞中 DCP2、RCK 或 EDC3 的过表达减少了内源性 DCP1A 和 XRN1(607994)与细胞质加工体的关联。EDC3也与TTP(ZFP36;190700)在转染的HEK293细胞中。

▼ 分子遗传学

2名同胞,由近亲叙利亚父母所生,患有轻度常染色体隐性遗传性智力发育障碍-50(MRT50; Ahmed et al.(2015)在EDC3基因中发现了一个纯合错义突变(F54S; 616460)。609842.0001)。通过纯合性作图和全外显子组测序发现的突变与该家族中的疾病分离。体外研究表明该突变会导致 mRNA 代谢异常。

▼ 等位基因变异体(1个精选示例):

.0001 智力发育障碍,常染色体隐性遗传 50(1 个家族)

EDC3、PHE54SER

2名同胞,由近亲叙利亚父母所生,患有轻度常染色体隐性遗传性智力发育障碍-50(MRT50; 616460),Ahmed et al.(2015)在EDC3基因中发现了一个纯合的c.161T-C转换(c.161T-C, NM_025083.3),导致保守的phe54到ser(F54S)取代LSM 域中的残基。该突变是通过纯合性作图和全外显子组测序发现的,与该家族中的疾病分离,并且在 ExAC 数据库或 700 多个内部外显子组中未发现。体外功能表达研究表明,与野生型蛋白不同,突变蛋白并没有增强DCP2(609844)的脱帽活性,表明其功能丧失。Ahmed et al.(2015)推测这会导致细胞中mRNA的异常积累,从而对神经元功能产生不利影响。

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