SLU7 同源物,剪接因子; SLU7
HGNC 批准基因符号:SLU7
细胞遗传学定位:5q33.3 基因组坐标(GRCh38):5:160,401,641-160,419,081(来自 NCBI)
▼ 说明
SLU7 是在前 mRNA 剪接第二步中选择正确的腺嘌呤-鸟嘌呤(AG)二核苷酸进行 3 素剪接位点选择所需的剪接因子(Chua 和 Reed,1999)。
▼ 克隆与表达
在 2 次酯交换反应中,内含子从核前 mRNA 中去除。剪接发生在剪接体中,剪接体是 snRNA 和大量蛋白质的动态复合物。步骤 1 的催化中心是在前 mRNA 上按照 E、A、B 和 C 的顺序形成一系列剪接体中间复合物后建立的,催化反应发生在复合物 C 中。 步骤 2 的剪接因子,例如 PRP18 (604993)和SLU7,将近端和远端的3-prime剪接位点带入剪接体的活性位点。通过在EST数据库中搜索酵母SLU7的同源物并通过PCR分析,Chua和Reed(1999)获得了编码人SLU7的cDNA。推导的 586 个氨基酸的蛋白质比酵母 Slu7 长 204 个氨基酸,与蠕虫和拟南芥蛋白质有 41% 的同一性。SLU7 包含一个锌指节,这是在多种剪接因子中发现的基序。蛋白质印迹分析显示 70 kD 核蛋白的表达,该蛋白在组装过程中相对较晚的阶段与剪接体结合。SLU7 与剪接体的结合与步骤 1 的催化作用相关。SLU7 的消耗导致新的中间 C 型剪接体复合物的积累,这些复合物在步骤 2 之前被阻断。
▼ 测绘
Stumpf(2021)根据SLU7序列(GenBank BC002348)与基因组序列(GRCh38)的比对,将SLU7基因定位到染色体5q33.3。
▼ 基因功能
正确剪接的信使 RNA 的产生需要 2 个催化剪接步骤。在步骤 2 中,外显子 1 攻击 3-prime 剪接位点处的 AG 二核苷酸。该 AG 通常位于分支位点下游 18 到 40 个核苷酸之间,并且会跳过较近的 AG,以支持位于更佳下游的 AG。Chua 和 Reed(1999)证明,Slu7 是选择正确的 AG 进行 3 素剪接位点选择所必需的。在缺少 Slu7 的情况下,正确的 AG 的使用会受到抑制,而错误的 AG 会被激活。Chua 和 Reed(1999)通过分析在没有 Slu7 的情况下组装的剪接体来研究这种保真度的损失。他们的研究表明,外显子 1 与这些剪接体松散相关。Chua and Reed(1999)得出结论,Slu7需要将外显子1紧紧地固定在剪接体内,以攻击预先指定的AG。
Sorek et al.(2002)表明,超过 5% 的人类选择性剪接外显子是 Alu 衍生的,并且大多数(如果不是全部)含 Alu 的外显子都是选择性剪接的。Lev-Maor et al.(2003)研究了内含子Alus转化为新外显子过程的分子基础和调控。他们发现,人类基因组中的内含子内至少有 238,000 个反义 Alus,其中许多易于外显子化。Alu 序列中使用哪个 AG 进行剪接位点选择取决于 Slu7 的浓度。Alus的组成性外显化已被证明会引起遗传性疾病,例如Alport综合征(见COL4A3, 120070.0006)、Sly综合征(253220.0010)和OAT缺乏症(258870.0023)。