5-磷酸羟基-L-赖氨酸磷酸裂解酶; PHYKPL

丙氨酸-乙醛酸氨基转移酶 2-样 2;AGXT2L2

HGNC 批准的基因符号:PHYKPL

细胞遗传学定位:5q35.3 基因组坐标(GRCh38):5:178,207,144-178,232,822(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Veiga-da-Cunha 等人(2012)使用 PCR 从肾脏 cDNA 文库中克隆了 AGXT2L2。AGXT2L2与AGXT2L1(614682)有67%的氨基酸同一性,但AGXT2L2的C端比AGXT2L1短约50个残基。

▼ 基因功能

Veiga-da-Cunha等人(2012)发现重组人AGXT2L2催化5-磷酸羟基-L-赖氨酸去磷酸化生成2-氨基己二酸半醛、氨和无机磷酸盐。AGXT2L2 不使用 5-羟基赖氨酸或充当转氨酶。

▼ 测绘

Hartz(2012)根据AGXT2L2序列(GenBank BC008009)与基因组序列(GRCh37)的比对,将AGXT2L2基因定位到染色体5q35.3。

▼ 分子遗传学

Veiga-da-Cunha 等人(2013)对磷酸羟赖氨酸尿症(PHLU;PHLU)患者的 AGXT2L2 基因进行了测序。615011),也具有Ehlers-Danlos综合征的特征(见130000),并鉴定出保守残基错义突变的复合杂合性(614683.0001-614683.0002)。功能研究表明,这些突变产生了不溶性、无功能的蛋白质。

▼ 等位基因变异体(2个精选例子):

.0001 磷酸羟基赖氨酸尿症(1名患者)

PHYKPL、GLY240ARG(rs201105857)

磷酸羟赖氨酸尿症(PHLU;615011),也具有Ehlers-Danlos综合征的特征(见130000),Veiga-da-Cunha等人(2013)鉴定出AGXT2L2基因中2个错义突变的复合杂合性。第一个是外显子 8 中的 970G-A 转变,导致 gly240 到 arg(G240R)的取代。该位置的甘氨酸在脊椎动物中是不变的。另一个突变是外显子12中的1562A-T颠换,导致glu437-to-val(E437V;614683.0002)替代。智人和斑马鱼的 AGXT2L2 和 AGXT2L1(614682)中都存在第 437 位的谷氨酸。功能研究表明,G240R 和 E437V 取代会产生不溶性蛋白质。Veiga-da-Cunha et al.(2013)报道,G240R突变(rs201105857)在欧洲人群中的等位基因频率为0.001,E437V突变(rs142181517)在北美人群中的等位基因频率为0.003,在欧洲人群中的等位基因频率为0.007 ,表明磷酸羟赖氨酸尿症是一种“非疾病”。

.0002 磷酸羟基赖氨酸尿症(1名患者)

PHYKPL、GLU437VAL(rs142181517)

对于glu437-to-val的讨论(E437V; AGXT2L2基因rs142181517)突变,在磷酸羟赖氨酸尿症(PHLU;PHLU)患者中发现复合杂合状态;Veiga-da-Cunha 等人(2013),参见 615011),参见 614683.0001。

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