SYMPLEKIN; SYMPK
SPK
HGNC 批准的基因符号：SYMPK
细胞遗传学定位：19q13.32 基因组坐标（GRCh38）：19:45,815,410-45,863,147（来自 NCBI）
▼ 说明
Symplekin 是一种 150-kD 的蛋白质，与睾丸极上皮细胞和支持细胞的紧密连接区（闭锁带）的细胞质面相关（Keon 等，1996）。核定位的SYMPK与异源三聚体裂解刺激因子（CSTF；参见300907），它参与mRNA的聚腺苷酸化，并且可能参与CSTF组装（Takagaki和Manley，2000）。SYMPK 在组蛋白 mRNA 的 3 引物末端成熟中也发挥着关键作用（Kolev 和 Steitz，2005）。
▼ 克隆与表达
Keon等人（1996）使用针对150-kD闭锁带蛋白的抗体筛选了人结肠癌cDNA表达文库并克隆了SYMPK。推导的 1,142 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 126.5 kD。SYMPK 的 N 端一半具有多个延伸的亲水片段，C 端一半具有交替的短疏水和亲水片段。SYMPK 在其 N 末端部分也有可能的核定位信号，并且几个假定的磷酸化位点遍布其整个序列。Northern 印迹分析在培养的极化上皮细胞以及腺癌和几种非上皮细胞中检测到大约 3.7 kb SYMPK 转录物。SYMPK 在碱性低盐或高盐缓冲液中部分提取，但完全提取需要非离子洗涤剂溶解。免疫组化和免疫金电子显微镜检测到极化上皮细胞根尖下紧密连接处有高表达的SYMPK，并与ZO1（TJP1；601009）。SYMPK 还显示，在所有检查的上皮细胞和非上皮细胞（包括未偶联细胞，如淋巴细胞、淋巴瘤和红白血病细胞）中，核质染色强烈，但排除核仁。
Ueki等人（1997）利用Northern印迹分析检测到一个4.2-kb SYMPK转录本，该转录本在骨骼肌中高表达，而在脑、心脏、肝脏、胎盘、肾、肺和胰腺中表达较低。
通过寻找强直性肌营养不良扩展重复序列200 kb内的基因（DMPK; 605377），随后通过成人大脑、睾丸和肌肉的 RT-PCR 以及数据库分析，Alwazzan 等人（1998）鉴定了 SYMPK。该转录本具有约 60 kb 的 5-prime UTR。Northern 印迹分析在心脏和大脑中检测到 4.5 kb SYMPK 转录本。
Takagaki 和 Manley（2000）报道，全长 SYMPK 有 1,273 个氨基酸，并包括一个大的 N 端结构域，与酵母 Pta1（酵母多聚腺苷酸化机制的一个组成部分）具有显着的相似性。Pta1 样结构域包含 4 个假定的核定位信号。Takagaki 和 Manley（2000）还鉴定了 SYMPK 的剪接变体，该变体编码推导的 1,058 个氨基酸同种型，该同种型与前 964 个氨基酸的长同种型相同，包括 Pta1 样结构域。这两种蛋白质的 C 端序列有所不同。
▼ 基因功能
Takagaki and Manley（2000）发现SYMPK与从HeLa细胞核中分离出的CSTF复合物共定位。核心 CSTF 子单元为 CSTF50（CSTF1; 600369）、CSTF64（CSTF2；300907）、CSTF77（CSTF3；600367）。SYMPK 直接与 CSTF64 相互作用，但不与纯化的 CSTF 异三聚体结合。Takagaki and Manley（2000）提出核SYMPK可能在CSTF组装中充当伴侣。
Kolev 和 Steitz（2005）将 SYMPK 鉴定为大型蛋白质复合物的关键子单元，在组蛋白 mRNA 的 3 引物末端成熟中发挥作用。他们使用小鼠组蛋白 H4-12 前体 mRNA 作为底物，从 HeLa 细胞核提取物中纯化了一种在 3 引物末端加工中起作用的复合物。该复合物包含切割和聚腺苷酸化特异性因子（CPSF）子单元 CPSF160（CPSF1; 606027）、CPSF100（CPSF2；606028）、CPSF73（CPSF3；606029）、CPSF30（CPSF4；603052）、FIP1（FIP1L1；607686），此外还有 CSTF77、CSTF64 和 SYMPK。这 8 种蛋白质的预测总分子量为 694 kD，与 14.7S 的复杂沉积一致。热处理导致复合物失活和解离，同时伴随着 SYMPK 的降解，这被证明是热不稳定的不稳定子单元。添加重组人 SYMPK 可恢复热灭活复合物对小鼠 H4-12 前 mRNA 的加工。Kolev 和 Steitz（2005）得出结论，SYMPK 是功能复合体完整性所必需的。
▼ 测绘
为了鉴定与人类神经胶质瘤有关的推定抑癌基因，Ueki et al.（1997）从粘粒定位到染色体19q13.3进行了外显子捕获，发现了6个与人类symplekin基因相匹配的外显子序列。5-prime 序列的一部分与从分析的大多数端粒粘粒中获得的附加捕获外显子序列相匹配。他们得出结论，symplekin 基因位于染色体 19q13.3 上的端粒到着丝粒方向。他们将 symplekin 基因分配到紧邻基因 59 和 DMPK 基因端粒的 40 kb 区域。
