SPT5 同源物, DSIF 延伸因子子单元; SUPT5H
TY 5 的抑制子,酿酒酵母,同系物
染色质结构调节剂,酵母,同源物;SPT5
HGNC 批准的基因符号:SUPT5H
细胞遗传学定位:19q13.2 基因组坐标(GRCh38):19:39,445,582-39,476,670(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
酵母Ty抑制基因(SPT)是根据其抑制Ty转座元件插入的能力而分离出来的。这些基因编码多种参与染色体活动的蛋白质,包括组蛋白和转录因子。SPT 基因不一定彼此同源。SPT4(603555)、SPT5和SPT6(601333)被认为是通过调节染色质结构参与转录抑制的蛋白质复合物的一部分。Jiang等人(1996)和Stachora等人(1997)克隆并鉴定了编码酵母SPT5的人类同源物的cDNA。蒋等人(1996)报道了该基因,符号为SUPT5H,编码1,087个氨基酸的多肽,与酵母SPT5有50%的相似性。SUPT5H的N端呈强酸性,而C端含有7个丝裂原激活蛋白(MAP)激酶共有序列。Stachora et al.(1997)指出SUPT5H序列包含一个推定的核定位信号。通过Northern印迹,Chiang等人(1996)表明SUPT5H在每个测试的成人组织中以不同水平表达为4-kb转录物。
Chiang et al.(1998)分离出编码小鼠Supt5h的cDNA。推导的小鼠和人类 SUPT5H 蛋白具有 97% 的序列同一性。
▼ 基因功能
Stachora et al.(1997)表明SUPT5H蛋白的水平在HeLa细胞的细胞周期中没有变化。然而,该蛋白质在有丝分裂过程中被可逆地磷酸化。
Yamada et al.(2006)表明,D-呋喃核糖基苯并咪唑敏感诱导因子(DSIF)是SPT4和SPT5的异二聚体,根据SPT5的磷酸化状态,抑制或激活HeLa细胞中RNA聚合酶II的转录延伸。
▼ 测绘
利用体细胞杂交和辐射杂交,Chiang等人(1996)将SUPT5H基因定位到人类染色体19q13。粘粒重叠群的筛选将该基因定位于 CLC 基因座(153310)约 250 kb 端粒处,以及 AKT2 癌基因(164731)约 1 Mb 着丝粒处,将其定位于 19q13.1。通过种间回交分析,Chiang et al.(1996)将Supt5h基因定位到小鼠染色体7中与人类19q13.1-q13.2同线性的区域。
▼ 动物模型
郭等人(2000)描述了一种名为“foggy”的斑马鱼突变体,它是在基因筛选中从影响神经元发育的突变中鉴定出来的。雾斑马鱼的下丘脑中含有多巴胺的神经元减少,而含有血清素的神经元相应过剩。定位克隆揭示了foggy是一种大脑富集的核蛋白,其结构与酵母转录延伸因子SPT5和人类SUPT5H相关。Foggy 是一种由 1,084 个氨基酸组成的蛋白质,而 SUPT5H 是一种由 1,087 个氨基酸组成的蛋白质。在保守区域,斑马鱼和人类之间有 88% 至 96% 的氨基酸同一性。Foggy 不是基本转录装置的一部分,而是转录延伸的磷酸化依赖性双重调节因子。雾状突变(val1012 变为 asp)破坏了其抑制活性,但未破坏其刺激活性。郭等人(2000)的结论是,他们的结果提供了分子、遗传和生物化学证据,证明转录延伸的负调节因子控制着神经元发育的关键方面。