仅 LIM 域 7;LMO7

仅 F 框蛋白 20;FBXO20
FBX20
KIAA0858

HGNC 批准的基因符号:LMO7

细胞遗传学定位:13q22.2 基因组坐标(GRCh38):13:75,620,434-75,859,870(来自 NCBI)

▼ 说明

LIM 结构域是富含半胱氨酸的双锌指结构基序,参与蛋白质-蛋白质相互作用。有关 LMO 基因家族的讨论,请参阅 186921。

▼ 克隆与表达

通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(1998)获得了部分 LMO7 克隆,他们将其命名为 KIAA0858。3-prime UTR包含一个短的散布核苷酸元件(SINE),推导的蛋白质包含一个锌指结构域。RT-PCR检测到在心脏、肺、骨骼肌和肾脏中高表达,在肝脏、卵巢、脑、胰腺和睾丸中中等表达,在脾脏中很少或没有表达。

Putilina 等人(1998)描述了编码单个 LIM 结构域的部分人胰腺 cDNA。他们确定 LIM 结构域由 2 个外显子编码。Northern 印迹分析在多个胎儿和成人组织中检测到 6 kb LMO7 转录物,在肺和心脏中表达强烈。免疫印迹分析发现核富集部分中存在 31-kD 和 16.5-kD 多肽,而胞质部分中存在 70-kD 蛋白质。作者确定,视网膜和大脑中 LMO7 的选择性剪接去除了 LIM 结构域的锌指。非神经组织似乎仅表达包含整个 LIM 结构域的形式。

使用SKP1作为酵母2-杂交筛选中的诱饵,并通过搜索DNA数据库,Cenciarelli等人(1999)鉴定了部分FBXO20序列。推导的蛋白质包含富含亮氨酸的重复序列,后面是 F 框。

Rozenblum et al.(2002)确定推导的LIMO7蛋白含有1,349个氨基酸。Northern印迹分析检测到肺、骨骼肌和肾脏中表达最高,胸腺、前列腺、睾丸、结肠、脊髓、肾上腺、胎盘和肝脏中中度至低表达。

Jin et al.(2004)报道FBXO20蛋白含有钙调蛋白(参见CNN1;600806)N端半部有同源结构域,中央F框和PDZ结构域,C端有LIM锌结合结构域。

利用Northern blot分析,Kurihara et al.(2002)发现单个Lmo7转录本在胚胎第7天低表达。在胚胎第11天没有检测到表达,但在胚胎第15天和第17天有2个转录本高水平表达。成年小鼠组织表达多个Lmo7转录本,其中在心脏中表达最高,但在脾脏中不表达。

Holaska et al.(2006)报道全长LMO7蛋白含有1,683个氨基酸。他们在 LMO7 中鉴定出了 2 个假定的核输出信号和 1 个预测的核定位信号。免疫荧光分析显示内源性 LMO7 定位于 HeLa 细胞的质膜、细胞质和细胞核。Holaska 等人(2006)使用不同的抗体也检测到强烈的核膜染色和一个明亮的核旁点,可能是中心体。

▼ 基因功能

Holaska 等人(2006)利用 HeLa 细胞 DNA 微阵列分析发现,HeLa 细胞中 LMO7 的敲低改变了 4,228 个特征基因和 542 个非特征基因的表达。抑制蛋白质核输出导致LMO7在核中积累,表明LMO7在细胞核和细胞质之间穿梭。核膜蛋白emerin的敲低(EMD; 300384)也​​减少了核LMO7的积累。免疫共沉淀和突变分析揭示了 LMO7 和 emerin 之间的直接相互作用,需要 LMO7 的 C 端部分和 emerin 的阻遏蛋白结合域 1(RBD1)和 RBD2。LMO7 C 末端的一半表达抑制了 emerin 基因表达并减少了核膜上的 emerin 染色。Holaska et al.(2006)得出结论,LMO7和emerin参与了相互反馈调节。

▼ 基因结构

Rozenblum et al.(2002)确定LMO7基因包含27个外显子,跨度超过238 kb。

Kurihara et al.(2002)在小鼠和人类LMO7基因的5-prime末端发现了一个保守的CpG岛。

▼ 测绘

Putilina et al.(1998)通过体细胞杂交分析将LMO7基因定位到染色体13。Rozenblum et al.(2002)通过基因组序列分析,将LMO7基因定位到染色体13q21-q22。Jin et al.(2004)指出小鼠Lmo7基因定位到染色体14E2.2。

▼ 动物模型

Acrg 最小区域是一个 1.5 至 1.7 Mb 的结构域,由内皮素 B 受体(EDNRB;EDNRB;131244)对小鼠染色体14的影响。该区域包含 Uchl3(603090)和 FBOX/PDZ/LIM 结构域蛋白 Lmo7。为了进一步剖析Acrg最小区域,Semenova等人(2003)利用Cre-loxP介导的基因工程产生了一个有针对性的800-kb缺失Lmo7(δ800),去除了该区域的远端部分。删除包括 Uchl3、Lmo7 以及 Lmo7 下游的另外 500 kb。百分之四十的这种缺失纯合子小鼠在出生和断奶之间死亡,并且严重矮小。Uchl3(δ3-7)和Lmo7(δ800)突变体均表现出视网膜、肌肉和生长迟缓,但Lmo7(δ800)纯合子中肌肉变性和生长迟缓的严重程度增强。作者认为,严重程度的增加可能反映了泛素介导的蛋白质降解途径中 Uchl3 和 Lmo7 之间的相互作用。

Tags: none