KATANIN 相互作用蛋白; KATNIP

HGNC 批准的基因符号:KATNIP

细胞遗传学定位:16p12.1 基因组坐标(GRCh38):16:27,550,144-27,780,344(来自 NCBI)

▼ 说明

KATNIP 基因编码一种与微管相关的纤毛碱基蛋白,该蛋白似乎可以调节微管稳定性(Sanders 等人总结,2015)。

▼ 克隆与表达

通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,Nagase 等人(1998)分离出了部分 KIAA0556 克隆。1,081个氨基酸序列与人胶原蛋白α-2(VIII)(COL8A2; 120252)。RT-PCR 在所有检查的 14 个人体组织中检测到可变的 KIAA0556 表达,其中肺中的表达最高,骨骼肌和脾中的表达最低。SDS-PAGE显示KIAA0556的表观分子量超过100 kD。

Sanders等(2015)在人视网膜色素上皮细胞中发现KIAA0556基因在睫状体基部、轴丝和睫状体尖端表达。在高表达细胞中,该蛋白质也定位于细胞质,似乎装饰丝状细胞骨架结构。在线虫中,Kiaa0556 直向同源基因在大多数纤毛细胞中表达,定位于纤毛基部和轴丝。这些发现表明它是一种高度保守的蛋白质。

▼ 测绘

Nagase等(1998)通过辐射杂交分析将KIAA0556基因定位到染色体16。Gross(2015)根据KIAA0556序列(GenBank AB011128)与基因组序列(GenBank AB011128)的比对,将KIAA0556基因定位到染色体16p12.1( GRCh38)。

▼ 基因功能

Sanders等人(2015)通过在视网膜上皮细胞中过表达KIAA0556,发现该蛋白与乙酰化α-微管蛋白信号共定位并直接与微管结合,反映了细胞质微管的稳定性增强。串联亲和纯化研究表明KIAA0556与多种katanin子单元(参见例如KATNA1, 606696)相互作用,包括KATNBL1(616235)。在线虫中,KIAA0056 调节纤毛 A 小管数量,并与 ARL13B(608922)直系同源基因相互作用以控制纤毛完整性。

▼ 分子遗传学

3 名同胞,父母为沙特阿拉伯近亲所生,患有 Joubert 综合征-26(JBTS26;Sanders et al.(2015)在KIAA0556基因中发现了纯合截短突变(Q892X;616784)。616650.0001)。该突变是通过外显子组测序发现的,并与家族中的疾病分离。

Roosing et al.(2016)在 2 个兄弟(由表亲印度父母(家族 1015)出生)携带 JBTS26 的 KIAA0556 基因(616650.0002)中发现了移码突变的纯合性。该突变与家庭中的疾病分离。

▼ 动物模型

Sanders et al.(2015)发现,Kiaa0556缺失的纯合子小鼠表现出不同的脑积水表型,由于脑导水管中的脑脊液流动受阻而导致脑室扩大。然而,详细分析显示心室室管膜纤毛结构或运动性没有明显缺陷。线虫中 Kiaa0556 直系同源物的破坏导致纤毛结构、功能和运输基本正常,但超微结构分析显示显着的微管缺陷。线虫研究表明 KIAA0556 与 ARL13B(608922)直向同源物相互作用以控制纤毛完整性。

▼ 等位基因变异体(2个精选例子):

.0001 朱伯特综合症 26

卡特尼普,GLN892TER

沙特阿拉伯裔近亲父母所生的 3 名儿童患有 Joubert 综合征-26(JBTS26;616784),Sanders et al.(2015)在KIAA0556基因中鉴定出纯合的c.2674C-T转换(c.2674C-T, NM_015202.2),导致gln892-to-ter(Q892X)取代。该突变是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与该家族中的疾病分离,并且在 615 个对照外显子组中未发现。患者细胞几乎不存在突变转录物,这与无义介导的 mRNA 衰减和功能完全丧失一致。与对照组相比,患者来源的成纤维细胞显示纤毛细胞数量显着减少,并且纤毛异常长。

.0002 朱伯特综合症 26

卡特尼普,1-BP DEL,NT4420

通过全外显子组测序,对 2 名兄弟进行了全外显子测序,他们的第一代表亲是印度人(家族 1015),患有 Joubert 综合征 26(JBTS26;616784),Roosing et al.(2016)鉴定了KIAA056基因中单个碱基对缺失c.4420del(chr16.17,786,375del, GRCh37)的纯合性,预测移码和过早终止密码子(Met1474CysfsTer11)和无义介导的mRNA衰变。该突变与家庭中的疾病分离。外显子组变异服务器、ExAC 或 1000 基因组计划数据库中未报告该变异。斑马鱼中单个 kiaa0556 直系同源基因的敲除导致了具有卷曲尾巴、小头部尺寸以及胸周和腹部水肿的变形体。这种表型可以通过野生型人类 KIAA0556 mRNA 来挽救。

Tags: none