三叶因子 2;TFF2
解痉蛋白1;SP;SML1
HGNC 批准的基因符号:TFF2
细胞遗传学定位:21q22.3 基因组坐标(GRCh38):21:42,346,357-42,350,994(来自 NCBI)
▼ 说明
解痉蛋白最初被鉴定为由猪胰腺提取物制备的商业胰岛素原液中的污染物,是猪解痉活性和胃酸分泌的抑制剂。其人类同源物与pS2蛋白(TFF1;113710),一种雌激素依赖性乳腺癌标志物,也是三叶蛋白家族的成员。三叶蛋白是一种小型分泌蛋白,其特征是具有 40 个氨基酸的三叶基序,其中包含 3 个保守的二硫键。3个链内二硫键形成三叶基序(TFF结构域)。它们用于维持或修复上皮粘膜,并促进细胞迁移。它们主要存在于胃肠组织中,并且在上皮损伤区域以及化生和瘤形成区域上调。另见TFF3(600633)。
▼ 克隆与表达
Tomasetto et al.(1990)根据蛋白质序列使用寡核苷酸探针克隆了猪SP cDNA。猪基因用于从胃 cDNA 文库中克隆人和小鼠 SP cDNA。人类 SP cDNA 编码预测的 129 个氨基酸的蛋白质。Northern印迹分析表明,人SP仅在正常胃上皮中表达;与 pS2 不同,它在乳腺癌中不表达。
▼ 基因功能
Hanby等人(1993)发现SP mRNA与pS2肽和整个胃的胃小凹和表面上皮中的mRNA共定位。他们表示 SP 和 pS2 的分布表明参与修复增强机制。
Itoh等(1996)检测了醋酸诱导的结肠炎过程中大鼠SP、大鼠pS2和大鼠肠三叶因子(Itf或Tff3)的表达。他们在结肠炎急性期检测到 pS2 mRNA,但在恢复期或正常对照中未检测到。Itf 在结肠炎急性期下调,然后在恢复期间上调。在诱导结肠炎的整个过程中未检测到SP mRNA。
▼ 基因结构
Seib et al.(1997)发现SP基因由4个外显子组成,跨度5.1 kb,其中外显子2和3各编码1个三叶结构域。
▼ 测绘
Tomasetto et al.(1992)通过原位杂交将SML1基因定位于21q22.3。利用脉冲场凝胶电泳,他们发现SML1位于BCEI(TFF1)基因的230 kb范围内。Theisinger 等人(1992)通过对一组携带不同人类染色体互补体的人类-啮齿动物体细胞杂交体的基因组 DNA 进行 Southern 印迹分析,将 SML1 基因定位到染色体 21。
Seib et al.(1997)发现SML1基因(SP)与TFF1和TFF3基因聚集在55-kb区域内,表明这些基因是由共同祖先基因通过复制进化而来的。
May和Westley(1997)确定TFF1和TFF2基因之间的物理距离仅为12.5 kb。TFF1 和 TFF2 基因具有相似的表达模式,表明它们可能具有共同的调控元件。
▼ 其他特点
TFF1、TFF2 和 TFF3 基因聚集在 21q22.3 中。TFF2 是唯一在孤立外显子上编码 2 个 TFF 结构域的基因。在这两个外显子之间的内含子 2 中,Kayademir 等人(1998)鉴定了一个新的 25 bp 序列,该序列串联重复约 48 次,并且在人类基因组中是独一无二的。一些个体中存在具有包含大约 53 个重复单元的第二等位基因的二等位基因多态性。Kayademir 等人(1998)在 BAC 重组体上克隆了两个等位基因。在 78 名白种人中,他们发现等位基因频率分别为 0.85 和 0.15,代表杂合性频率为 26%。猿和猴物种表现出较短总阵列长度的同源重复,而在其他哺乳动物中则没有发现。