ATPase,H+ 转运,溶酶体,56/58-KD,V1 子单元 B,异构体 2; ATP6V1B2
ATP6B2
液泡质子泵 B 异构体 2
HGNC 批准的基因符号:ATP6V1B2
细胞遗传学定位:8p21.3 基因组坐标(GRCh38):8:20,197,381-20,221,696(来自 NCBI)
▼ 说明
ATP6B2 编码液泡 ATP 酶(V-ATPase)的一个组分,V-ATP 酶是一种介导细胞内细胞器酸化的多子单元酶。编码的蛋白质是催化结构域内包含的 2 B 子单元亚型之一。另见 ATP6B1(192132)。
▼ 克隆与表达
通过使用 V-ATPase B 子单元的共有 PCR 引物,Bernasconi 等人(1990)从人脑 cDNA 文库中克隆了部分 ATP6B2 cDNA。推导的 511 个氨基酸的蛋白质与 ATP6B1 具有 90% 的序列同一性,并在人脑中以 3.2 kb 的转录本表达。
Nelson 等人(1992)从人肾 cDNA 文库中克隆了全长 ATP6B2 cDNA。B1 和 B2 亚型的序列分析表明蛋白质内部区域高度保守,但 N 端和 C 端存在分歧。Van Hille 等人(1994)通过使用破骨细胞瘤 mRNA 的 RT-PCR 克隆了同种型 B2,他们将其称为 HO57。他们发现 1.6、2.6 和 2.8 kb 的 3 种 mRNA 普遍表达。在大脑和肾脏以及原始破骨细胞瘤中发现高水平的表达,在胰腺中发现中等水平的表达,在肝脏、肺、胎盘、心脏和肌肉中发现较低水平的表达。通过对破骨细胞瘤肿瘤进行原位杂交,他们发现破骨细胞中有高水平的 B2 转录本。在性交后第16天小鼠胚胎中,在大脑的第五颅神经节和正在发育的肾小管网络中观察到高水平的子单元B mRNA。在椎骨、肋骨和下颌骨的大细胞中也检测到高水平的转录物,显示出破骨细胞的形态特征。
Yuan等(2014)对小鼠耳蜗切片和培养的耳蜗组织进行免疫染色后,观察到Atp6v1b2在出生后早期耳蜗(出生后第2天)和成年耳蜗(出生后第1天)中主要表达于柯蒂氏器和螺旋神经节神经元。 30)。
▼ 基因结构
Lee et al.(1995)发现5-prime侧翼区含有一个G+C含量高的TATA-less启动子,并且在5-prime UTR和近端编码区有多个AP2和SP1结合位点。
▼ 测绘
国际辐射混合图谱联盟将ATP6B2基因定位到染色体8(stSG1675)。
▼ 基因功能
Lee等人(1995)使用B2同工型抗体对V-ATP酶复合物的几个子单元进行了免疫沉淀,并证实了B2同工型的存在。他们还发现,V-ATP酶的恢复量随着单核细胞分化而增加。通过核径流分析,他们确定 ATP6B2 mRNA 在天然单核细胞和人单核细胞白血病细胞系细胞的分化过程中特异性转录上调。
▼ 分子遗传学
耳聋,先天性,伴有甲营养不良,常染色体显性遗传
3名无血缘关系的中国先证者患有先天性耳聋、无甲、无名指中节指骨发育不全(先天性耳聋伴甲营养不良,或DDOD;Yuan et al.(2014)鉴定出ATP6V1B2基因(R506X;R506X;124480)中的一个从头无义突变的杂合性。606939.0001)。这种突变在所有 3 个家族中都与疾病分离,但在 1,053 个种族匹配、听力正常的对照组或人类遗传变异数据库中均未发现。
Menendez 等人(2017)在一名患有 DDOD 的 12 岁危地马拉男孩中鉴定出 ATP6V1B2 中复发性 R506X 突变的杂合性。
齐默尔曼-拉班德综合症 2
2 名无关的牙龈增生和无甲患者(Zimmerman-Laband 综合征,或 ZLS2;Kortum et al.(2015)鉴定出ATP6V1B2基因(R485P;R485P;616455)中相同的从头错义突变存在杂合性。606939.0002)。
▼ 动物模型
在耳蜗特异性Atp6v1b2敲低小鼠模型中,Yuan等人(2014)观察到注射吗啉寡聚物的小鼠出现剂量依赖性听力损失表型。免疫染色显示,Atp6v1b2 的表达在整个耳蜗中显着降低,尤其是在毛细胞和螺旋神经节神经元中。
▼ 等位基因变异体(2个精选例子):
.0001 先天性耳聋,伴有甲营养不良,常染色体显性遗传
ATP6V1B2、ARG506TER
3名无亲属关系的中国先证者患有先天性耳聋、无甲、无名指中节指骨发育不全(DDOD;124480),Yuan et al.(2014)鉴定了ATP6V1B2基因中的从头c.1516C-T转变(c.1516C-T, NM_001693.3)的杂合性,导致arg506到ter(R506X)的取代预计去除 6 个高度保守的残基。这种突变在每个家族中随疾病而分离,在 1,053 个种族匹配、听力正常的对照组、1000 个基因组计划、HapMap、外显子组变异服务器或内部 BGI 数据库中均未发现。HEK293 细胞的转染研究表明,与野生型相比,R506X 突变体的 ATP 酶水解活性降低。使用溶酶体特异性染料测量 V-ATP 酶的质子转运活性显示,野生型转染细胞和突变型转染细胞之间的溶酶体 pH 值存在统计学显着差异,表明 R506X 突变体的酸化减少。
Menendez 等人(2017)在一名患有 DDOD 的 12 岁危地马拉男孩中鉴定出 ATP6V1B2 基因中复发性 R506X 突变的杂合性。他未受影响的父母和兄弟姐妹没有携带这种突变。
.0002 齐默曼-拉班综合症 2
ATP6V1B2、ARG485PRO
一名男性患者(患者7)患有Zimmermann-Laband综合征(ZLS2;616455),最初由 Abo-Dalo 等人(2008)报道为患者 6,以及 Castori 等人(2013)先前研究的一名患有 ZLS 的意大利女孩(患者 8),Kortum 等人(2015)鉴定了杂合性ATP6V1B2 基因中的从头 c.1454G-C 颠换(c.1454G-C, NM_001693.3),导致 α 螺旋片段内完全保守的残基处由 arg485 替换为 pro(R485P)。在两个家庭中未受影响的父母中,或者在 dbSNP(build 138)、1000 Genomes Project、Exome Variant Server 或 ExAC 数据库中均未发现该突变。