氯离子通道配件 1；CLCA1

氯离子通道，钙激活，1
钙激活氯离子通道 1；CACC1
GOB5

HGNC 批准的基因符号：CLCA1

细胞遗传学定位：1p22.3 基因组坐标（GRCh38）：1:86,468,927-86,500,259（来自 NCBI）

▼ 说明

CLCA1 属于钙依赖性氯离子通道家族。氯离子通道参与电解通量的调节，从而调节分泌、吸收、细胞体积和膜电位（Agnel 等人总结（1999））。

▼ 克隆与表达

鼠钙激活氯通道Clca1（Gandhi et al., 1998）、牛钙激活氯通道Clca1和牛肺内皮细胞粘附分子-1（Lu-ECAM-1）都是蛋白质家族的成员似乎在多种组织中介导钙激活的氯化物电导。这些蛋白质在大小、序列（75% 至 89% 同一性）和预测结构方面具有高度同源性，但其组织分布却存在显着差异。Gruber等人（1998）通过利用牛Lu-ECAM-1的开放阅读码组筛选人类基因组文库，克隆了该家族的人类成员CLCA1。Northern blot 分析仅在人小肠和结肠粘膜中检测到 3.3 kb CLCA1 转录物。原位杂交显示 CLCA1 仅在肠基底隐窝上皮和杯状细胞中表达。Gruber et al.（1998）利用基于基因组序列的引物，使用RT-PCR克隆了人小肠CLCA1 cDNA。CLCA1 cDNA 编码推导的 914 个氨基酸的蛋白质，计算分子量为 100.9 kD。人 CCLLA1 与小鼠 Clca1、牛 Clca1 和牛 Lu-ECAM-1 具有 67% 的氨基酸同一性。预测的人类 CLCLA1 蛋白具有信号序列、4 个跨膜结构域、C 末端有一个大的疏水区以及许多潜在的糖基化和磷酸化位点。

Gruber等人（1999）基于CLCA2（604003）的糖基化位点扫描和蛋白酶保护分析，预测CLCA1含有5个跨膜结构域。

Agnel等人（1999）利用牛Cacc1查询人EST数据库，然后对人结肠cDNA文库进行RACE，克隆了CLCA1，他们将其命名为CACC1。推导的 914 个氨基酸蛋白具有 N 端信号肽和高度保守的 HExxH 锌结合基序。CACC1与CACC2（CLCA4；CLCA4；616857）与CACC3（CLCA2；616857）同源性为45% 604003）。Northern印迹分析检测到一个2.9-kb的转录物，该转录物在结肠和小肠中高表达，在胃和前列腺中表达较弱。对 50 个人体组织的 RNA 斑点印迹分析显示，子宫、阑尾、肾脏、睾丸和胎儿脾脏中还有额外的 CACC1 表达。

▼ 基因功能

Gruber 等人（1998）证明重组人 CLCA1 作为前体蛋白表达，并被加工成 2 个细胞表面相关的子单元。HEK 293 细胞中重组 CLCA1 蛋白的表达导致全细胞钙敏感氯电流增加，该电流被 DIDS、二硫苏糖醇和尼氟酸向外整流和抑制。

Woodruff等人（2007）利用基因表达芯片发现CLCA1、periostin（POSTN；608777）、SERPINB2（PAI2；173390）在哮喘患者的气道上皮细胞中表达上调（见600807），但吸烟者则不然。皮质类固醇治疗下调这3个基因的表达，上调FKBP51（602623）的表达。CLCA1、POSTN 和 SERPINB2 的高基线表达与皮质类固醇的良好临床反应相关，而 FKBP51 的高表达与不良反应相关。用 IL13 处理气道上皮细胞导致 CLCA1、POSTN 和 SERPINB2 表达增加，这种效应可以被皮质类固醇抑制。

▼ 基因结构

Gruber et al.（1998）确定CLCA1基因包含15个外显子，跨度为31.9 kb。L1 转座元件位于预测的启动子区域内。

▼ 测绘

Gruber et al.（1998）通过FISH将CLCA1基因定位到染色体1p31-p22。

Pauli et al.（2000）报道CLCA1定位到染色体1p31-p22上的CLCA基因簇。小鼠 Clca1 基因对应到染色体 3H2-H3 上的同线性基因簇。

Gross（2016）根据CLCA1序列（GenBank AF127036）与基因组序列（GRCh38）的比对，将CLCA1基因定位到染色体1p22.3。