RHO GTP 酶激活蛋白 6;ARHGAP6

GTP 酶激活蛋白,RHO,6; RHOGAP6

HGNC 批准的基因符号:ARHGAP6

细胞遗传学定位:Xp22.2 基因组坐标(GRCh38):X:11,137,544-11,665,920(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

寻找小眼球伴线性皮肤缺陷综合征(MLS;MLS;309801),Schaefer et al.(1997)从 Xp22.3 中 500-kb MLS 关键区域的 14 个重叠粘粒中捕获了外显子。通过外显子连接和 cDNA 文库筛选,他们在 MLS 缺失区域中鉴定了 2.4 kb 的 cDNA 克隆重叠群,跨越 170 kb 的基因组序列。对该 cDNA 的 Northern 分析在所有检查的组织中检测到大约 4.2 kb 的显着转录本和大约 6 kb 的较不丰富的转录本,以及骨骼肌中的其他转录本。序列分析揭示了12个外显子中包含601个氨基酸的编码区,以及495个氨基酸的剪接变体亚型。该基因的预测蛋白序列,符号为ARHGAP6,与Rho-GAP蛋白家族的GTP酶激活(GAP)结构域(如300023)具有同源性,该结构域参与质膜肌动蛋白聚合的调节在几个细胞过程中。Schaefer et al.(1997)讨论了认为Rho通路缺陷可能在MLS综合征的发病机制中发挥作用的原因。

▼ 基因结构

Iwase et al.(2007)确定AMELX(300391)以相反的方向存在于ARHGAP6的内含子1中。

▼ 基因功能

Prakash et al.(2000)通过生成Arhgap6缺失小鼠以及体外表达研究来研究ARHGAP6的功能。令人惊讶的是,Arhgap6 的 rhoGAP 功能丧失并没有导致突变小鼠出现任何可检测到的表型或行为异常。表达 ARHGAP6 的转染哺乳动物细胞失去了肌动蛋白应力纤维,从生长表面缩回,并延伸出类似于丝状伪足的细细分支过程。ARHGAP6 蛋白通过 N 末端结构域与肌动蛋白丝共定位,并将丝状肌动蛋白募集到生长过程中。rhoGAP 结构域中保守的精氨酸残基的突变阻止了应力纤维的损失,但对过程的生长几乎没有影响。作者得出结论,ARHGAP6 具有 2 个孤立的功能:一个是对 RhoA 具有特异性的 GAP,另一个是促进肌动蛋白重塑的细胞骨架蛋白。

为了确定牙釉质形成过程中使用了哪些Arhgap6启动子,Hu et al.(2012)从小鼠第一磨牙分泌期(第5天)和成熟期(第12天)的成釉细胞和牙釉质器官上皮细胞(EOE)中分离了mRNA。在分泌期成釉细胞或 EOE 或成熟期成釉细胞中未检测到来自启动子 1a 和 1c 的 Arhgap6 表达。在成熟状态 EOE 中从这些启动子中检测到痕量表达。在分泌期成釉细胞和 EOE 中,启动子 1b 的 Arhgap6 表达较低,但可检测到,并且在成熟阶段成釉细胞和 EOE 中明显更强。Hu et al.(2012)得出结论,在发育中的小鼠磨牙中,Arhgap6几乎完全从发育中的磨牙中的启动子1b表达,并且主要在成熟阶段。

▼ 测绘

Schaefer等人(1997)在Xp22.3上为小眼症伴线性皮肤缺损综合征定义的关键区域内鉴定了ARHGAP6基因。

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