YIPPEE-LIKE 3; YPEL3
HGNC 批准基因符号:YPEL3
细胞遗传学定位:16p11.2 基因组坐标(GRCh38):16:30,092,314-30,096,213(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Hosono等人(2004)通过寻找与YPEL1(608082)相似的序列,然后筛选睾丸cDNA文库,克隆了YPEL3。推导的 119 个氨基酸蛋白与小鼠和猴子 Ypel3 具有 100% 的氨基酸一致性,与果蝇 Yippee 具有 45.5% 的氨基酸一致性。YPEL3 与 YPEL1、YPEL2(609723)和 YPEL4(609725)具有 83.9% 至 89.1% 的氨基酸同一性。所有 YPEL 蛋白均包含 86 个氨基酸的 YPEL 共有序列。PCR 分析检测到所有成人和胎儿组织中 YPEL3 的表达。在胰腺、胎盘和睾丸中检测到第二个 YPEL3 转录本。COS-7 绿猴肾细胞的免疫荧光染色将 Ypel3 定位于间期的中心体和核仁,以及有丝分裂期期间有丝分裂器周围的几个点状结构。
Kelley等人(2010)通过对人乳腺上皮细胞和结肠癌细胞系进行Western blot分析,发现YPEL3的表观分子质量约为15 kD。
▼ 基因功能
Kelley et al.(2010)发现p53(TP53;TP53;191170)p53诱导DNA损伤后的激活。染色质免疫沉淀和报告基因检测显示 p53 直接结合并激活 YPEL3 启动子。YPEL3 的过度表达会减少人类细胞系和成纤维细胞的生长并引发细胞衰老。Kelley等人(2010)通过筛选8种不同的人类肿瘤类型,发现相对于对照,YPEL3在肺、结肠和卵巢肿瘤样本中表达下调。在卵巢肿瘤中,下调似乎是通过 YPEL3 启动子内 CpG 岛的高甲基化发生的。
▼ 基因结构
Hosono et al.(2004)确定YPEL3基因包含5个外显子,跨度约4 kb。外显子 1 未翻译。小鼠Ypel3基因具有相同的结构。
Kelley et al.(2010)发现YPEL3启动子区有一个约950 bp的CpG岛。
▼ 测绘
Hosono et al.(2004)通过基因组序列分析,将人类YPEL3基因定位到染色体16p11.2,将小鼠Ypel3基因定位到染色体7F4。