高密度脂蛋白胆固醇水平定量性状基因座 14; HDLCQ14

细胞遗传学定位:11q23.3 基因组坐标(GRCh38):11:114,600,001-121,300,000

▼ 测绘

Kort等人(2000)评估了105个犹他州大型家系中低α脂蛋白血症特征与11q23之间联系的证据,这些家系与早期先天性心脏病密切相关,并在血脂异常的基础上进行了扩展。2 点和多点连锁分析均使用 55 cM 区域中的 22 个 STRP 标记进行。通过基于一般显性表型模型的 2 点分析,发现完整谱系的 Lod 分数为 2.9,167 个 4 代分裂谱系的 Lod 分数为 3.5。进一步的分析确定了 11q23.3 上的区域,距 APOA1/C3(107680)/A4(107690)位点(也在 11q23 上)远端约 10 cM,并且明显不同于该位点,因此代表了低 HDLC 表型的假定新定位。

Kim等人(2011)结合韩国KARE项目(n = 8,842)和HEXA共享对照研究(n = 3,703)的全基因组关联结果进行了荟萃分析,验证了从发现荟萃分析中选择的基因座的关联性。复制阶段(来自日本 BioBank 全基因组关联研究的 30,395 名个体以及由 Health2 和上海交通大学糖尿病队列组成的个体)。Kim等(2011)鉴定出rs11216126(chr11:116,122,450, NCBI36)与HDL胆固醇显着相关,效应等位基因(频率)为0.20(p = 2.6 x 10(-34))。Kathiresan 等人(2009)之前也注意到了类似的效果。同一区域有一个孤立的SNP rs603446,与甘油三酯水平相关(p = 2.03 x 10(-65))。

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